RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-201ENST00000537686 FGF16O43320 207 aa8.31□□□□□ -1.08
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GGA3-201ENST00000537686 ADIPOQQ15848 244 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-201ENST00000537686 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
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GGA3-201ENST00000537686 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GGA3-201ENST00000537686 RNF125Q96EQ8 232 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-201ENST00000537686 KCNS1Q96KK3 526 aa8.31□□□□□ -1.08
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GGA3-201ENST00000537686 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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GGA3-201ENST00000537686 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-201ENST00000537686 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-201ENST00000537686 ASCL4Q6XD76 172 aa8.27□□□□□ -1.09
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GGA3-201ENST00000537686 REG4Q9BYZ8 158 aa8.27□□□□□ -1.09
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GGA3-201ENST00000537686 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GGA3-201ENST00000537686 A0A087WWC5 75 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-201ENST00000537686 A0A0G2JRQ6 117 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-201ENST00000537686 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-201ENST00000537686 LINC00587B1AMM8 73 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-201ENST00000537686 SOD3P08294 240 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-201ENST00000537686 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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