RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARV1Q9H2C2 271 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP5D1E7EU14 171 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTSGP08311 255 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLC1P0CG04 106 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RD3LP0DJH9 198 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL3P36405 182 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PROK1P58294 105 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF616Q08AN1 781 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MIC13Q5XKP0 118 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STOML3Q8TAV4 291 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q8WTZ3 238 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC140Q96MF4 163 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRGV9Q99603 122 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RFNGQ9Y644 331 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PRX2 142 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F8W735 103 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TGOLN2O43493 480 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 YIF1AO95070 293 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2C1O95371 312 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN15O95858 294 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV12-3P01733 135 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSG1P11464 419 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SELENOTP62341 195 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM209BQ5JX69 171 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZRG5 221 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMED6Q8WW62 240 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP6V0BQ99437 205 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F8P00451 2351 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOMM40O96008 361 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNA7P01567 189 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-17P01599 117 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC11BP0C7V7 166 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00869P0C866 280 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPP1P10451 314 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ORM2P19652 201 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADMP35318 185 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP10-3P60369 221 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B2MP61769 119 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERF2P84101 59 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX261Q6UWH6 196 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STPG3Q8N7X2 389 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPF1Q92782 380 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF320A2RRD8 509 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BMPR1BO00238 502 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COX7A2P2O60397 106 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms