RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	LCN2	P80188	198 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	HES1	Q14469	280 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	PFDN5	Q99471	154 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035		A6NNC1	897 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	CD99	P14209	185 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	BPIFB3	P59826	476 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	OR5I1	Q13606	314 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	RNF2	Q99496	336 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	RNF5	Q99942	180 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEG3-222	ENST00000524035	HELT	A6NFD8	242 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	NBR2	O15453	112 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	TGOLN2	O43493	480 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	S100A8	P05109	93 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	CEACAM3	P40198	252 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	SELENOT	P62341	195 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	CENPW	Q5EE01	88 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	SLC17A3	O00476	420 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035		A0A1W2PRE2	83 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035		C9JCJ5	164 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	PPP1R2P9	O14990	202 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	GNG4	P50150	75 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	TRGV9	Q99603	122 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	EFNA4	P52798	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	CORT	O00230	105 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	FXYD3	Q14802	87 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	FXYD5	Q96DB9	178 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035		I3L2K1	104 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	NPB	Q8NG41	125 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	NDUFA3	O95167	84 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	SMIM6	P0DI80	62 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	FOXL1	Q12952	345 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	PERP	Q96FX8	193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035		S4R3C0	116 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	TYMS	P04818	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	PAX2	Q02962	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	TIGIT	Q495A1	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035		H3BTX0	84 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	HYPM	O75409	117 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	PSG1	P11464	419 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	IMMP2L	Q96T52	175 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEG3-222	ENST00000524035	LYZ	P61626	148 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	FLNC	Q14315	2725 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035		K7EIM0	57 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-222	ENST00000524035	TOX4	O94842	621 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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