RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 GPR31O00270 319 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PPYP01298 95 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV2-23P01705 113 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 APOA1P02647 267 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CTRB1P17538 263 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 F2RP25116 425 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 RCVRNP35243 200 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 NPBWR1P48145 328 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 XGP55808 180 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SYNJ2BPP57105 145 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SRPXP78539 464 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 HES5Q5TA89 166 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PLET1Q6UQ28 207 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR1P1Q8NH06 330 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 GALNT14Q96FL9 552 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CNBD2Q96M20 576 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CLCC1Q96S66 551 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ATG101Q9BSB4 218 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 LCE6AA0A183 80 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf70A6NJV1 201 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR11H12B2RN74 326 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf94C9JXX5 98 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 E5RGE8 158 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINE2P07093 398 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C8orf88P0DMB2 117 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 FOLR2P14207 255 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CBLN1P23435 193 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 FCGR2CP31995 323 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS3P35030 304 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SNCAP37840 140 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 RND3P61587 244 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TSPAN5P62079 268 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 NDPQ00604 133 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF9Q07011 255 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 MEF2DQ14814 521 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 IDNKQ5T6J7 187 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C22orf42Q6IC83 251 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR10K2Q6IF99 312 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 OR5T1Q8NG75 326 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ENY2Q9NPA8 101 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 NSG2Q9Y328 171 aa3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0A6YYD4 124 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf51A6NDU8 294 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM235A6NFC5 223 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 HELTA6NFD8 242 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 C15orf61A6NNL5 157 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 FCN1O00602 326 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 TGOLN2O43493 480 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-11P01762 117 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A4P12235 298 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 ANXA3P12429 323 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 CNTFRP26992 372 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 RORCP51449 518 aa3.12□□□□□ -1.91
HDAC2-216ENST00000523628 AP3S2P59780 193 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms