RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A1B0GX78 115 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 DHFRP00374 187 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGKV1-5P01602 117 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP3K7CLP57077 242 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 STX3Q13277 289 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 GRK1Q15835 563 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 ESRGQ1W209 222 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q8N402 240 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 TERB2Q8NHR7 220 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 TP53RKQ96S44 253 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYTH2Q99418 400 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 MS4A6AQ9H2W1 248 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 UNC13CQ8NB66 2214 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 COL6A3P12111 3177 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 SBF1O95248 1867 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIF13BQ9NQT8 1826 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 LY6G6CO95867 125 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPYP01298 95 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD14P08571 375 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 BRMS1LQ5PSV4 323 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC51BQ86UW2 128 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 CNBD2Q96M20 576 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCL19Q99731 98 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIFC1Q9BW19 673 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC39A9Q9NUM3 307 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 DKKL1Q9UK85 242 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 F8P00451 2351 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD2P06729 351 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL3P08700 152 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCL2P13500 99 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYT1P21579 422 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 FXYD4P59646 89 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 XIAPP98170 497 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 BATFQ16520 125 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 GUK1Q16774 197 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPINK13Q1W4C9 94 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR5L1Q8NGL2 311 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPER1Q99527 375 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR51I2Q9H344 312 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERGIC3Q9Y282 383 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 POFUT2Q9Y2G5 429 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-397P-201ENST00000516226 MGAMO43451 1857 aa-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYCBP2O75592 4640 aa-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 NCOR1O75376 2440 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 TGP01266 2768 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 C7orf71A4D174 169 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 F5H768 121 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 COX7CP15954 63 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 CASP1P29466 404 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 HBA1P69905 142 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNM1P34Q6PK57 102 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q6ZS49 121 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR13C4Q8NGS5 318 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR2T35Q8NGX2 323 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 LPAR5Q9H1C0 372 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 OSTCQ9NRP0 149 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1orf109Q9NX04 203 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 POLR1DQ9Y2S0 133 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITPR3Q14573 2671 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 FREM3P0C091 2139 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPRR2DP22532 72 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 KDELR2P33947 212 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP2K4P45985 399 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLDN12P56749 244 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLAMF1Q13291 335 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 COQ5Q5HYK3 327 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR8D4Q8NGM9 314 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 DHRS9Q9BPW9 319 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 BCL7BQ9BQE9 202 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 TP73-AS1Q9UF72 201 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 HSPB8Q9UJY1 196 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 DCCP43146 1447 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 VWFP04275 2813 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFNA10P01566 189 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 HLA-DRAP01903 254 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNJ3P48549 501 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-397P-201ENST00000516226 SERPINB9P50453 376 aa-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms