RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF747Q9BV97 191 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 HINT2Q9BX68 163 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 CACNA1EQ15878 2313 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 A0A096LNJ9 63 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 A1L4Q6 167 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 ID1P41134 155 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 SYT8Q8NBV8 401 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PRD5 423 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PRF3 423 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PRM7 423 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 A8MWL6 223 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRRG2O14669 202 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PYYP10082 97 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 NFE4Q86UQ8 179 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 TM2D2Q9BX73 214 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 MGAQ8IWI9 3026 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 COX19Q49B96 90 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 UTF1Q5T230 341 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 RFESDQ8TAC1 157 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 GFRA3O60609 400 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PROP1O75360 226 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 WISP2O76076 250 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 MKXQ8IYA7 352 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PTH2Q96A98 100 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 ERG28Q9UKR5 140 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 A0A096LPE4 126 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PPZ6 126 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 LIPFP07098 398 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM13P0DJ93 91 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 TMPRSS3P57727 454 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 CACNG7P62955 275 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 Q6P435 159 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 FA2HQ7L5A8 372 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRO0461Q9UI25 63 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PTPRBP23467 1997 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1B0GW15 77 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 OR5AL1P0C617 328 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 SFTA2Q6UW10 78 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 NABP2Q9BQ15 211 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 DKK2Q9UBU2 259 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 OR2H2O95918 312 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 CELA2AP08217 269 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRR20EP86478 221 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRR20CP86479 221 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRR20DP86480 221 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRR20BP86481 221 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PRR20AP86496 221 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 CATR1Q13166 79 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 GALMQ96C23 342 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 KIR2DL4Q99706 377 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 A0A0J9YW62 118 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3B-220ENST00000495571 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms