RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 OR9G9P0C7N8 305 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 FOLR2P14207 255 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RPA2P15927 270 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 M6PRP20645 277 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 GADD45AP24522 165 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 MYL9P24844 172 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SERPINB10P48595 397 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 FHITP49789 147 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TMBIM6P55061 237 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 FABP5Q01469 135 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SSX1Q16384 188 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 C15orf32Q32M92 178 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CNPY1Q3B7I2 92 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CDNFQ49AH0 187 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 LY6G6FQ5SQ64 297 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR107Q5VW38 600 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 C22orf42Q6IC83 251 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 LCN12Q6JVE5 192 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM71F2Q6NXP2 309 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 IL34Q6ZMJ4 242 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 DEFB125Q8N687 156 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 OR4A4PQ8NGN8 299 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 OR10R2Q8NGX6 335 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CACNG8Q8WXS5 425 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 PTX4Q96A99 478 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 MGLLQ99685 303 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF5Q99942 180 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TM2D3Q9BRN9 247 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 FUNDC2Q9BWH2 189 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC2A8Q9NY64 477 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TAS2R8Q9NYW2 309 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB22AQ9UL26 194 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SPATA2Q9UM82 520 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 LYSTQ99698 3801 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 METTL21EPA6NDL7 271 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 IFITM5A6NNB3 132 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 OR11H12B2RN74 326 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 H3BUA1 57 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ITGB1BP1O14713 200 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 BCL2L11O43521 198 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 OR2A4O95047 310 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 BRI3O95415 125 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CRYGBP07316 175 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RRASP10301 218 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 PTHLHP12272 177 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 DEFA4P12838 97 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 AREGP15514 252 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CD36P16671 472 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 CNN1P51911 297 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 FXYD4P59646 89 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 GNG2P59768 71 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 UBE2KP61086 200 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SSTP61278 116 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 VBP1P61758 197 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 S100A12P80511 92 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF45Q02386 682 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TPBGQ13641 420 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TRAM1Q15629 374 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC38A6Q8IZM9 456 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 Q8N402 240 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 OR52B4Q8NGK2 314 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB2BQ8WUD1 216 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 USMG5Q96IX5 58 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ADTRPQ96IZ2 230 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SPIN2AQ99865 258 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 HINT2Q9BX68 163 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 HRASLSQ9HDD0 168 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 PRR34Q9NV39 138 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 NDUFB11Q9NX14 153 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD28-211ENST00000492895 MBD2Q9UBB5 411 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms