RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 PPP1R3DO95685 299 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 PTHP01270 115 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 AKAIN1P0CW23 69 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 CT45A10P0DMU9 189 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 ATF1P18846 271 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 G6PCP35575 357 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 EMP1P54849 157 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 RAB40BQ12829 278 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 PRDX4Q13162 271 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 MEF2DQ14814 521 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 UBE2V2Q15819 145 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 BATFQ16520 125 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 TIGITQ495A1 244 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 OR2T27Q8NH04 317 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNRF4Q8WWF5 429 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 C4orf45Q96LM5 186 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC00477Q96M19 166 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.84□□□□□ -1.63
JMJD1C-208ENST00000490669 TGP01266 2768 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 hADV38S2A0JD32 116 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 C9JAW5 83 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 K7EPK0 472 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 RER1O15258 196 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SPRY3O43610 288 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BKO60814 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 NDUFB2O95178 105 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SOX14O95416 240 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SIX6O95475 246 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 FSTL3O95633 263 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BJP06899 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM106CPP0CH98 169 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 GNB3P16520 340 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BOP23527 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 NFYBP25208 207 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BBP33778 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 PROK1P58294 105 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BDP58876 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BCP62807 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 PSG9Q00887 426 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 GJC3Q8NFK1 279 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 UPRTQ96BW1 309 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 DERL3Q96Q80 235 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 OR2D2Q9H210 308 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 IQCF6A8MYZ5 107 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 B4DEV8 164 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 MCRIP1C9JLW8 97 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 F8VVB4 439 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 F8VWA3 439 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM178BH3BS89 294 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SOCS2O14508 198 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SPRY2O43597 315 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 CDRT1O95170 752 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF728P0DKX0 622 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 NUDT2P50583 147 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 PCBD1P61457 104 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 GNG5P63218 68 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 PAX8Q06710 450 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.82□□□□□ -1.64
JMJD1C-208ENST00000490669 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms