RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	AREG	P15514	252 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	PLP1	P60201	277 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOB	P62745	196 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TRGV9	Q99603	122 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SSX3	Q99909	188 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	DOK5	Q9P104	306 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GV50	99 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	COLCA2	A8K830	154 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247		F6UZH7	168 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CLN5	O75503	358 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CTRB1	P17538	263 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTFR	P26992	372 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	GCHFR	P30047	84 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10J1	P30954	320 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	RND2	P52198	227 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MFAP2	P55001	183 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	DLX1	P56177	255 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	HNF4G	Q14541	408 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF212	Q495C1	297 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL19	Q99731	98 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPV4	95 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247		I3L2K1	104 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	FCN1	O00602	326 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MT-CO2	P00403	227 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OPN1MW	P04001	364 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R45	P59539	299 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	KLRD1	Q13241	179 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	MMD	Q15546	238 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TNXA	Q16473	311 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZWC4	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4A-208	ENST00000489247	PFDN5	Q99471	154 aa		4.37	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms