RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 SGMS2Q8NHU3 365 aa2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 FNDC9Q8TBE3 224 aa2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 GPR119Q8TDV5 335 aa2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 GPR146Q96CH1 333 aa2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 ZNF609O15014 1411 aa2.85□□□□□ -1.95
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CCL20-204ENST00000489160 DPRXA6NFQ7 191 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 TP53I11O14683 189 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 DEGS1O15121 323 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G10O15496 165 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 NDUFC2O95298 119 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 CPMP14384 443 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 CRYBB3P26998 211 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 CSN1S1P47710 185 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 AKR1D1P51857 326 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 NCALDP61601 193 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
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CCL20-204ENST00000489160 TAF9Q16594 264 aa2.84□□□□□ -1.95
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 EFCAB11Q9BUY7 163 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 TMEM222Q9H0R3 208 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 SSR3Q9UNL2 185 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 ZNF835Q9Y2P0 537 aa2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CCL20-204ENST00000489160 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 TONSLQ96HA7 1378 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 KIF1BO60333 1816 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 CEP162Q5TB80 1403 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 OVOS2Q6IE36 1432 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 ADGRL2O95490 1459 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 C1orf167Q5SNV9 1468 aa2.84□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 DOCK8Q8NF50 2099 aa2.83□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 IFT172Q9UG01 1749 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.83□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 C16orf90A8MZG2 172 aa2.83□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 UBBP0CG47 229 aa2.83□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 SMIM17P0DL12 118 aa2.83□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 SSX8Q7RTT4 187 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 FAM24BQ8N5W8 94 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 ZNF709Q8N972 641 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 DEDD2Q8WXF8 326 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 CUL9Q8IWT3 2517 aa2.83□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 MYO10Q9HD67 2058 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GX51 115 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 TMEM189A5PLL7 270 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 H7C1C5 153 aa2.82□□□□□ -1.96
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CCL20-204ENST00000489160 S100A11P31949 105 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R30P59541 319 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 DEFA3P59666 94 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 LCN6P62502 163 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 GNG5P63218 68 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 SELENOWP63302 87 aa2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
CCL20-204ENST00000489160 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.82□□□□□ -1.96
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