RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 NECAP1Q8NC96 275 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 SLC35E1Q96K37 410 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 MS4A10Q96PG2 267 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 AQP10Q96PS8 301 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 MLST8Q9BVC4 326 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 MFFQ9GZY8 342 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 HSPB11Q9Y547 144 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 RNF222A6NCQ9 220 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 HMSDA8MTL9 139 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 B5MCH6 92 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 SCGB2A1O75556 95 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 NDUFB8O95169 186 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 BRI3O95415 125 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 MT-CO2P00403 227 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 PSMB8P28062 276 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 DLK1P80370 383 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ATP5G2Q06055 141 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 OR2F1Q13607 317 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF345Q14585 488 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 CLINT1Q14677 625 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 C15orf32Q32M92 178 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ACSM6Q6P461 480 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ACY3Q96HD9 319 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 CXorf58Q96LI9 332 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 HYLS1Q96M11 299 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 FBXL17Q9UF56 701 aa5.95□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 A0A0G2JLM5 398 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 PRSS46E5RG02 174 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 I3L2K1 104 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 K7EIM0 57 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 DFFBO76075 338 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 S100A11P31949 105 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 RND2P52198 227 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 PROK1P58294 105 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 KLK9Q2XQG4 91 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 Q56UQ5 140 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 LURAP1LQ8IV03 231 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 RNF152Q8N8N0 203 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 UBAC2Q8NBM4 344 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 USMG5Q96IX5 58 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ATP5SQ99766 215 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 GGACTQ9BVM4 153 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 KLK15Q9H2R5 256 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 PLXNB1O43157 2135 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 A0A0D9SG52 128 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 FNDC10F2Z333 226 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 BCL2L11O43521 198 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 IFNA5P01569 189 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-11P01762 117 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-48P01763 117 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV3-23P01764 117 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 C4BPBP20851 252 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 NPBWR1P48145 328 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 RAB9AP51151 201 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 MFAP4P55083 255 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 NHLH2Q02577 135 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ARL16Q0P5N6 197 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ATP6V1FQ16864 119 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 AWAT1Q58HT5 328 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 FAM209BQ5JX69 171 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-218ENST00000487565 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms