RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 Q6ZPA2 131 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 OCC1Q8TAD7 63 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 PP6455Q8WZ26 134 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 PIGTQ969N2 578 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 WIPF1O43516 503 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CRYAAP02489 173 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CD3EP07766 207 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 B4GALT1P15291 398 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SSTR5P35346 364 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 GPR12P47775 334 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 REG1BP48304 166 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 UBE2G1P62253 170 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 ATP5G2Q06055 141 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 Q56UQ5 140 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 GAPTQ8N292 157 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 C7orf71A4D174 169 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 C2orf70A6NJV1 201 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 NPY1RP25929 384 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 ATP5G3P48201 142 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 DSCR9P59020 149 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 PSG7Q13046 419 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 FHL3Q13643 280 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 MMD2Q8IY49 270 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 LYZL4Q96KX0 146 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 C1RLQ9NZP8 487 aa6.25□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 B5MCH6 92 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 BMPR1BO00238 502 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SLC17A3O00476 420 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 NTF3P20783 257 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SRIP30626 198 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 IAPPP10997 89 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CRYBB3P26998 211 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CDAP32320 146 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CX3CL1P78423 397 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CDIP1Q9H305 208 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 COL12A1Q99715 3063 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 PLAUP00749 431 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 Q6ZRM9 215 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 RDH5Q92781 318 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.24□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 ANK2Q01484 3957 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 LRP5LA4QPB2 252 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 C9orf118A6NHY6 69 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 K7EN84 100 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 DHRS3O75911 302 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 LHBP01229 141 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SEC11AP67812 179 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 GAGE5Q13069 117 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 GAGE6Q13070 117 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TIGITQ495A1 244 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 Q6ZS49 121 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 RAX2Q96IS3 184 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 GPHA2Q96T91 129 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 HLA-DQA1P01909 254 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TM2D2Q9BX73 214 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 V9GYV3 84 aa6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF6BO95407 300 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 F2RP25116 425 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 INSL3P51460 131 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 C5orf63A6NC05 138 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 OR4C46A6NHA9 309 aa6.22□□□□□ -1.41
USP4-211ENST00000485450 H3BRM9 83 aa6.22□□□□□ -1.41
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