RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARL16	Q0P5N6	197 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	HBG1	P69891	147 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	HBG2	P69892	147 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMLR1	H3BR10	107 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	S100A11	P31949	105 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	DLK1	P80370	383 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1QL4	Q86Z23	238 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	LYL1	P12980	280 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF546	Q86UE3	836 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	VWF	P04275	2813 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDUFA4	O00483	81 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	BAX	Q07812	192 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLINT1	Q14677	625 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q8WTZ3	238 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAP30	O75446	220 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGLL1	P15814	213 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF90	Q03938	601 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	TM4SF20	Q53R12	229 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	TEPP	Q6URK8	271 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	FNDC10	F2Z333	226 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	LGALS9	O00182	355 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	FABP1	P07148	127 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSG1	P11464	419 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2F1	Q13607	317 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRGV9	Q99603	122 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402		G3V3Q6	166 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARPC5	O15511	151 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOMM40	O96008	361 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL4	P05112	153 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	EDN2	P20800	178 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB31	Q13636	194 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOLR2	P14207	255 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBLN1	P23435	193 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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