RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 E9PLN8 166 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DRB4P13762 266 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PCSK4Q6UW60 755 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 BADQ92934 168 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CRYGSP22914 178 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DTX1Q86Y01 620 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C18orf12Q96KH6 178 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LAMA4Q16363 1823 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0B4J2E0 115 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GX12 115 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LYRM9A8MSI8 78 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 J3QQQ9 107 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TIMM23O14925 209 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 EPPINO95925 133 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 EMDP50402 254 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 FAM201AQ5SY85 155 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PRR19A6NJB7 356 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 NXPH1P58417 271 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SPRY4Q9C004 299 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 NBR2O15453 112 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TDHQ8IZJ6 230 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 IL17DQ8TAD2 202 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 EMC6Q9BV81 110 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 IGHG3P01860 377 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LY6KQ17RY6 165 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DKK4Q9UBT3 224 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00312Q9Y6C7 94 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 GRPP07492 148 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TFF3Q07654 80 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 MORN5Q5VZ52 161 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZS92 163 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C20orf197Q8N268 126 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SERP2Q8N6R1 65 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GUL6 1792 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 H3BT86 120 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM14DPA8MWL7 114 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DDB2Q92466 427 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 CXCL10P02778 98 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-209ENST00000442510 CYBAP13498 195 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 NBL1P41271 181 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-209ENST00000442510 C22orf39Q6P5X5 142 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF799Q96GE5 643 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-209ENST00000442510 F5H697 171 aa4.59□□□□□ -1.68
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PTPRC-209ENST00000442510 LINC01620Q4KN68 170 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf85Q96MD7 179 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM14Q96QK8 99 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 GFI1Q99684 422 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF747Q9BV97 191 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 FOXE3Q13461 319 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 NUP205Q92621 2012 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV40A0A0B4J280 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 SOCS3O14543 225 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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