RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ENY2Q9NPA8 101 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR2T8A6NH00 312 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 H3BP45 60 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 DEDDO75618 318 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 C1QBP02746 253 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CLEC3BP05452 202 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 MFAP2P55001 183 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 Q56UQ5 140 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 DTD1Q8TEA8 209 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 NUPR2A6NF83 97 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 E5RGE8 158 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 LY6G6CO95867 125 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -12e-6■□□□□ 10
PRAME-210ENST00000442481 SNCAP37840 140 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR2C3Q8N628 320 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 RAB40CQ96S21 281 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 RNF126Q9BV68 326 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 RETNQ9HD89 108 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PSENENQ9NZ42 101 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR11H12B2RN74 326 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ARPC5O15511 151 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 TGOLN2O43493 480 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 TMEM50AO95807 157 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-48P01763 117 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A4P12235 298 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 EDN2P20800 178 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CAV2P51636 162 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 NOXA1Q86UR1 476 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR1P1Q8NH06 330 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 CXorf65A6NEN9 183 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 IFNA10P01566 189 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 P2RY1P47900 373 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 PAX9P55771 341 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 GUCA2BQ16661 112 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 KLK9Q2XQG4 91 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 ZNF546Q86UE3 836 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 SMIM8Q96KF7 97 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 HYLS1Q96M11 299 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 HERC2O95714 4834 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 IGSF23A1L1A6 192 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 C2orf70A6NJV1 201 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 K7EIM0 57 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 TSC22D2O75157 780 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 MT-CO2P00403 227 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 FOLR2P14207 255 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R30P59541 319 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 GPHB5Q86YW7 130 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 DEFB125Q8N687 156 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 C15orf62A8K5M9 175 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-210ENST00000442481 YIF1AO95070 293 aa8.75□□□□□ -1.01
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