RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 AKR1C3P42330 323 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 RND2P52198 227 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TNXAQ16473 311 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FAM168AQ92567 244 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 RITA1Q96K30 269 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 YPEL4Q96NS1 127 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 UHRF2Q96PU4 802 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 SSX3Q99909 188 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 PARLQ9H300 379 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 BIN3Q9NQY0 253 aa8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 A0A096LNT2 108 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TIMM23O14925 209 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 NBR2O15453 112 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FOXH1O75593 365 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 C8orf88P0DMB2 117 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV4-31P0DP07 118 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 CTRB1P17538 263 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 PDLIM4P50479 330 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 LGALS4P56470 323 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 BPIFB3P59826 476 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 EBI3Q14213 229 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FAM78BQ5VT40 261 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 CST9LP1Q5W188 147 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 CTRB2Q6GPI1 263 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 HCP5Q6MZN7 132 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 C12orf54Q6X4T0 127 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FAM24BQ8N5W8 94 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM116Q8NCL8 245 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 STXBP6Q8NFX7 210 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM190Q8WZ59 177 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 CFHR4Q92496 578 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 BTF3L4Q96K17 158 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TRGV9Q99603 122 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 LY96Q9Y6Y9 160 aa8□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFS8O00217 210 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R2P9O14990 202 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TCF21O43680 179 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FABP1P07148 127 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2E1P51965 193 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 PLGLAQ15195 96 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 NPIPB3Q92617 1050 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf52Q96A22 123 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ISOC2Q96AB3 205 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ACY3Q96HD9 319 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 SIRPDQ9H106 197 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PRE2 83 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 PSMB11A5LHX3 300 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TEX22C9J3V5 150 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 COX7A2P2O60397 106 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 CNIH1O95406 144 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 S100PP25815 95 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 LMO4P61968 165 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ELOBQ15370 118 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 MMDQ15546 238 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ADIRFQ15847 76 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 MLANAQ16655 118 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 IMMP2LQ96T52 175 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FBXL15Q9H469 300 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 C1RLQ9NZP8 487 aa7.98□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TGP01266 2768 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 C9JCJ5 164 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 TOX4O94842 621 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 FAM106CPP0CH98 169 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 CNTFRP26992 372 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 BRS3P32247 399 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 PLP1P60201 277 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2G2P60604 165 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 GNB1P62873 340 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.97□□□□□ -1.13
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms