RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DSPPQ9NZW4 1301 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRAV18A0A075B6X5 111 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CXCL13O43927 109 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 YPEL1O60688 119 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HYPMO75409 117 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NXPH3O95157 252 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HBE1P02100 147 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC35A1P78382 337 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ALG10Q5BKT4 473 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MARCH3Q86UD3 253 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 YPEL2Q96QA6 119 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NUDT14O95848 222 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CXCL1P09341 107 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGLC2P0DOY2 106 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGLC3P0DOY3 106 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PMVKQ15126 192 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KCNRGQ8N5I3 272 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TEX29Q8N6K0 151 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OR1L1Q8NH94 360 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLAMF6Q96DU3 332 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FUT9Q9Y231 359 aa4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FBN2P35556 2912 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POLQO75417 2590 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF732B4DXR9 585 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DIRC3C9JPN6 131 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PGA4P0DJD7 388 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PGA5P0DJD9 388 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TSPOP30536 169 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 S100A3P33764 101 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CTRLP40313 264 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF626Q68DY1 528 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 Q6AWC8 147 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 APOOLQ6UXV4 268 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 Q6ZUT4 128 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PROCRQ9UNN8 238 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AKAP6Q13023 2319 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 K7EP34 96 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TACSTD2P09758 323 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BCL3P20749 454 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TPPP2P59282 170 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DKK2Q9UBU2 259 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MED31Q9Y3C7 131 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LINC00312Q9Y6C7 94 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ABCA4P78363 2273 aa4.94□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C16orf97H3BN30 126 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC25A6P12236 298 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LCN6P62502 163 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ELOBQ15370 118 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF709Q8N972 641 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RITA1Q96K30 269 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C9orf85Q96MD7 179 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FZR1Q9UM11 496 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PDZD2O15018 2839 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CHEK1O14757 476 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 COX5AP20674 150 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PMAIP1Q13794 54 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF550Q7Z398 422 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPANXCQ9NY87 97 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPG11Q96JI7 2443 aa4.93□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SCTP09683 121 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC25A4P12235 298 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FABP6P51161 128 aa4.92□□□□□ -1.62
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF117Q03924 483 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms