RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM168AQ92567 244 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 NRGNQ92686 78 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TBX15Q96SF7 602 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 A1L4Q6 167 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE6DO43924 150 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 COX7A2P2O60397 106 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CLN5O75503 358 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5G3P0C626 314 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10J4P0C629 311 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ORM2P19652 201 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF212Q495C1 297 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4X1Q8NH49 305 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PERPQ96FX8 193 aa3.16□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 DERL1Q9BUN8 251 aa3.16□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.16□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 B4DEV8 164 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CORTO00230 105 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFA3O95167 84 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CRYGCP07315 174 aa3.16□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf88P0DMB2 117 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB5AP20339 215 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SAA4P35542 130 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2E1P51965 193 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R45P59539 299 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CX3CL1P78423 397 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MORN5Q5VZ52 161 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF843Q8N446 348 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 THAP8Q8NA92 274 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF114Q8NC26 417 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 NPBQ8NG41 125 aa3.16□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.16□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 LRRK2Q5S007 2527 aa3.16□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 F6UZH7 168 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN34H7C241 214 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SELENOTP62341 195 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOBQ15370 118 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PATE2Q6UY27 113 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 MALSU1Q96EH3 234 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF503Q96F45 646 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SSX3Q99909 188 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.15□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.15□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 FAM106CPP0CH98 169 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CTRB1P17538 263 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 HNF1AP20823 631 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB5BP61020 215 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 NECAP1Q8NC96 275 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8WTZ3 238 aa3.15□□□□□ -1.9
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LRRTM4-201ENST00000409088 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
LRRTM4-201ENST00000409088 S4R3C0 116 aa3.15□□□□□ -1.9
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