RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 C2orf83Q53S99 150 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 MISP3Q96FF7 219 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CCDC32Q9BV29 185 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 C15orf62A8K5M9 175 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 MPTX1A8MV57 137 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 IFNA4P05014 189 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 Q56UQ5 140 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 RARRES2Q99969 163 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 CSTL1Q9H114 145 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 FBXL17Q9UF56 701 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-204ENST00000403441 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-204ENST00000403441 OR4X1Q8NH49 305 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 SMPXQ9UHP9 88 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 CENPXA8MT69 81 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 YIF1AO95070 293 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 TMEM50AO95807 157 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-48P01763 117 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 VAMP1P23763 118 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 NPBWR1P48145 328 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 TFPI2P48307 235 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 INPP1P49441 399 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 OR11H2Q8NH07 326 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 RNF2Q99496 336 aa9.07□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 ENY2Q9NPA8 101 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.06□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 LYRM1O43325 122 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 GNG7O60262 68 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 CLN5O75503 358 aa9.06□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 TCTAP57738 103 aa9.06□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 RBKSQ9H477 322 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 U3KQ87 197 aa9.06□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 HERC2O95714 4834 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.05□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 IGKV1-17P01599 117 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 CD5P06127 495 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A4P12235 298 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 NPY1RP25929 384 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 OPRK1P41145 380 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 PAFAH1B2P68402 229 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 ZNF124Q15973 351 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 MLANAQ16655 118 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 BATF3Q9NR55 127 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.04□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 NOXA1Q86UR1 476 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.04□□□□□ -0.96
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PRAME-204ENST00000403441 MITD1Q8WV92 249 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 GINS3Q9BRX5 216 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 VSIRQ9H7M9 311 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-204ENST00000403441 PRSS46E5RG02 174 aa9.03□□□□□ -0.96
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