RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10J1P30954 320 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 NPIPB3Q92617 1050 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 ACY3Q96HD9 319 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 L7N2F9 121 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLC1P0CG04 106 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 VAMP2P63027 116 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8WTZ3 238 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-202ENST00000379615 SSNA1O43805 119 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TSC22D2O75157 780 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1-17P01599 117 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TIGITQ495A1 244 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SMPXQ9UHP9 88 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TGP01266 2768 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP92A6NM28 416 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BP45 60 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CD5P06127 495 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RD3LP0DJH9 198 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 GAMTQ14353 236 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 GUCA2BQ16661 112 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 BTNL8Q6UX41 500 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 MLXQ9UH92 298 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PS18 150 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 GOSR2O14653 212 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 NPPCP23582 126 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL26Q96S19 204 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 C7orf66A4D0T2 115 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 K7EPK0 472 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TOMM40O96008 361 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RLN2P04090 185 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 EDN2P20800 178 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PAX9P55771 341 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A10P60903 97 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF785A8K8V0 405 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CHEK1O14757 476 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 BCAP31P51572 246 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 AKR1C1Q04828 323 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 IL15RAQ13261 267 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS21Q2M5E4 152 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TRGV9Q99603 122 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS46E5RG02 174 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 FNDC10F2Z333 226 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPAN4O14817 238 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CAV2P51636 162 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 DLK1P80370 383 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 THAP8Q8NA92 274 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 NMES1Q9C002 83 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 SMCO3A2RU48 225 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 SIX6O95475 246 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 IL4P05112 153 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 PSG1P11464 419 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYBB3P26998 211 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 CD81P60033 236 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 PAFAH1B2P68402 229 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB32Q13637 225 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 GGACTQ9BVM4 153 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4C46A6NHA9 309 aa11.57□□□□□ -0.56
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