RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 DPRXA6NFQ7 191 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MC5RP33032 325 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MYCNOSP40205 109 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 BSPH1Q075Z2 132 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SLAQ13239 276 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TBR1Q16650 682 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PPI3 338 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A17O43808 307 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SMIM12Q96EX1 92 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PERPQ96FX8 193 aa14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0G2JNJ9 132 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MFAP2P55001 183 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT11Q96G61 164 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 Q9UFV3 132 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 K7EM74 188 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 IGHV3-48P01763 117 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 FOSL1P15407 271 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 DLX6P56179 175 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 NUP35Q8NFH5 326 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TSKUQ8WUA8 353 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CCL17Q92583 94 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CTRLP40313 264 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 LGALS7P47929 136 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2G1P62253 170 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SSX8Q7RTT4 187 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 NIT1Q86X76 327 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.67□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CRYGCP07315 174 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PRRX1P54821 245 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CTSZQ9UBR2 303 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PRRG2O14669 202 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 THBDP07204 575 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 G0S2P27469 103 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PRR27Q6MZM9 219 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 TRGV9Q99603 122 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 EPDR1Q9UM22 224 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C22orf46C9J442 243 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MOSP00540 346 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 PLAUP00749 431 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 C3orf79P0CE67 100 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 GNG5P63218 68 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA45Q537H7 98 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 BORCS7Q96B45 105 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 KAAG1Q9UBP8 84 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 OR2J3O76001 311 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 CA7P43166 264 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS3-201ENST00000355530 HIGD1CA8MV81 97 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 VSTM5A8MXK1 200 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 ORM2P19652 201 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 TEX45Q8NA69 505 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 NTF3P20783 257 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 BLNKQ8WV28 456 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 RITA1Q96K30 269 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 GPR82Q96P67 336 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1B0GXF2 115 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 CORTO00230 105 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 HCP5Q6MZN7 132 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 FMC1Q96HJ9 113 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS3-201ENST00000355530 PGPA6NDG6 321 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms