RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 GGACTQ9BVM4 153 aa10.12□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 IGSF23A1L1A6 192 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 A8MWP6 167 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFA4O00483 81 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1-17P01599 117 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 SULT1A1P50225 295 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 ARL16Q0P5N6 197 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 FAM106AQ4KMX7 169 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 STX12Q86Y82 276 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OR9G4Q8NGQ1 327 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM190Q8WZ59 177 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 ACY3Q96HD9 319 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 MBD2Q9UBB5 411 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 OR10J1P30954 320 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 FGL1Q08830 312 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 THAP8Q8NA92 274 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CHAC2Q8WUX2 184 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 PEMTQ9UBM1 199 aa10.1□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 WIPF1O43516 503 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 CST7O76096 145 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 HBG1P69891 147 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 HBG2P69892 147 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 BAXQ07812 192 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 TIGITQ495A1 244 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM144Q7Z5S9 345 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 THAP6Q8TBB0 222 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa10.09□□□□□ -0.79
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM213A2RRL7 107 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TOMM40O96008 361 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 IGLL1P15814 213 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 S100A11P31949 105 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 INSL3P51460 131 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 AKR1C1Q04828 323 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SLC38A11Q08AI6 406 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 VWC2Q2TAL6 325 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 OR2T35Q8NGX2 323 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TRGV9Q99603 122 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ELOVL1Q9BW60 279 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 NPVFQ9HCQ7 196 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SORL1Q92673 2214 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF320A2RRD8 509 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf70A6NJV1 201 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ZFP92A6NM28 416 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 G3V3Q6 166 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 K7EMT4 169 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 CSN3P07498 182 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 NHLH2Q02577 135 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6V1FQ16864 119 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 Q5BKY6 102 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM217Q8N7C4 229 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SMCO3A2RU48 225 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 FABP1P07148 127 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 C8orf88P0DMB2 117 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 RPL12P30050 165 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 LILRB2Q8N423 598 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 Q8WTZ3 238 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 MARC2Q969Z3 335 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 GINS3Q9BRX5 216 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM147Q9BVK8 224 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 HSPB11Q9Y547 144 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 SAP30O75446 220 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 YIF1AO95070 293 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 RD3LP0DJH9 198 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 PSG1P11464 419 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF90Q03938 601 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TM4SF20Q53R12 229 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 TEPPQ6URK8 271 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 OR51G1Q8NGK1 321 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 AQP10Q96PS8 301 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf24Q9BUV8 137 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.05□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 G3V4G9 280 aa10.04□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 CFDP00746 253 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV1-51P01701 117 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms