RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290921.10

CTBP1-201, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTBP1, Length 2,297 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-201ENST00000290921 WT1-ASQ06250 92 aa20.39■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 PMCHL1Q16048 86 aa20.39■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 TMEM177Q53S58 311 aa20.39■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 FXYD5Q96DB9 178 aa20.39■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa20.38■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 CORTO00230 105 aa20.38■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 GNG5P63218 68 aa20.38■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 OR5AN1Q8NGI8 311 aa20.38■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa20.38■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 SAP30LQ9HAJ7 183 aa20.38■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 FAM181BA6NEQ2 426 aa20.37■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 CGB1A6NKQ9 187 aa20.37■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.37■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 TNFRSF19Q9NS68 423 aa20.37■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 HIGD1CA8MV81 97 aa20.37■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 FSTL3O95633 263 aa20.37■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 CAMPP49913 170 aa20.37■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20.37■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 PLAUP00749 431 aa20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 CCL3L1P16619 93 aa20.36■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 Q6ZS92 163 aa20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 C7orf69Q9H7B7 122 aa20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 OR2J3O76001 311 aa20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 NUP37Q8NFH4 326 aa20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 SFTPCP11686 197 aa20.35■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 TSPOP30536 169 aa20.35■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 17.4
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CTBP1-201ENST00000290921 THAP8Q8NA92 274 aa20.35■□□□□ 0.85
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CTBP1-201ENST00000290921 SGK494Q96LW2 274 aa20.34■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 EPDR1Q9UM22 224 aa20.34■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 PDPNQ86YL7 162 aa20.33■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 VSTM2AQ8TAG5 236 aa20.33■□□□□ 0.85
CTBP1-201ENST00000290921 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa20.33■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 TNFRSF1AP19438 455 aa20.33■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa20.33■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 BLNKQ8WV28 456 aa20.33■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa20.32■□□□□ 0.84
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CTBP1-201ENST00000290921 A0A1B0GXF2 115 aa20.32■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.32■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.31■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 PGPA6NDG6 321 aa20.31■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 C2orf70A6NJV1 201 aa20.31■□□□□ 0.84
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CTBP1-201ENST00000290921 PRR31Q5SQ13 230 aa20.31■□□□□ 0.84
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CTBP1-201ENST00000290921 TMEM108Q6UXF1 575 aa20.3■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 TCF24Q7RTU0 167 aa20.3■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 OR2D3Q8NGH3 330 aa20.3■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 RPH3ALQ9UNE2 315 aa20.3■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 IGLV2-23P01705 113 aa20.3■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa20.3■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 PERPQ96FX8 193 aa20.3■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 C17orf100A8MU93 164 aa20.29■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 KIR3DL3Q8N743 410 aa20.29■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 OR1B1Q8NGR6 318 aa20.29■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 FAM57AQ8TBR7 257 aa20.29■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 CBY1Q9Y3M2 126 aa20.29■□□□□ 0.84
CTBP1-201ENST00000290921 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa20.29■□□□□ 0.84
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