RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FCN1O00602 326 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC24A4Q8NFF2 622 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 ADTRPQ96IZ2 230 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM68Q96MH6 324 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 K7EN84 100 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 PRR20DP86480 221 aa21.23■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR20BP86481 221 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 IFI27L2Q9H2X8 130 aa21.22■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35E1Q96K37 410 aa21.21■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 YAE1D1Q9NRH1 226 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF586Q9NXT0 402 aa21.19■□□□□ 0.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa21.17■□□□□ 0.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 FSTL3O95633 263 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 HNF1AP20823 631 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R45P59539 299 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TIGITQ495A1 244 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF841Q6ZN19 808 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV3A0A0B4J244 114 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 B4DSR2 109 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM30BQ3MIR4 351 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 GPX1P07203 203 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 MSMBP08118 114 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4A47Q6IF82 309 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM216BQ8N7L0 139 aa21.16■□□□□ 0.98
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