RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638043.1

MBD5-231, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 5, human

APPRIS P1 TSL 5

Gene MBD5, Length 3,483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MBD5-231	ENST00000638043	HERV-K104	P61576	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	CCL24	O00175	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	LYZL6	O75951	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	PLAU	P00749	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	PYY	P10082	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	CSN1S1	P47710	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MBD5-231	ENST00000638043	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	ELOC	Q15369	112 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	CEND1	Q8N111	149 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	PCTP	Q9UKL6	214 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043		F2Z2F3	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	FGF1	P05230	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	SFTPD	P35247	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	TMEM187	Q14656	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	IGLL5	B9A064	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	APCS	P02743	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	CD7	P09564	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	CCL1	P22362	96 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	ZNF134	P52741	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	TCF15	Q12870	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	LRP6	O75581	1613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	MYLK	Q15746	1914 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043		K7EM74	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	OVOL3	O00110	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	CLDN17	P56750	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043		Q6ZS49	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBD5-231	ENST00000638043	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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