RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	OMG	P23515	440 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RHOB	P62745	196 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MPV17L2	Q567V2	206 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	DOK3	Q7L591	496 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ERAS	Q7Z444	233 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR86	Q86TI4	376 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2C3	Q8N628	320 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB1C	Q92928	201 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5S	Q99766	215 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM189	A5PLL7	270 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EP34	96 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM78B	Q5VT40	261 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SSX8	Q7RTT4	187 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	LGI3	Q8N145	548 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	HINT2	Q9BX68	163 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		5.94	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SH2D1B	O14796	132 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	BRI3	O95415	125 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	LRTM2	Q8N967	370 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C18orf12	Q96KH6	178 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	THYN1	Q9P016	225 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMB11	A5LHX3	300 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OVOL3	O00110	214 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00869	P0C866	280 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GNG3	P63215	75 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RUNX1	Q01196	453 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	EFNB3	Q15768	340 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TM2D1	Q9BX74	207 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ST20	Q9HBF5	79 aa		5.93	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT3	O95989	172 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DRB1	P01911	266 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	OR3A4P	P47883	348 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	AMT	P48728	403 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	AP1S3	Q96PC3	154 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	PSG8	Q9UQ74	426 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495		H0YJW9	148 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNA5	P01569	189 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT2	P09544	360 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF728	P0DKX0	622 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	AMY2B	P19961	511 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC11A	P67812	179 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC21	Q5SSG8	566 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	BORCS7	Q96B45	105 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	LY6G6D	O95868	133 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL3	P20749	454 aa		5.92	□□□□□ -1.46
LETMD1-238	ENST00000623495	SSTR5	P35346	364 aa		5.92	□□□□□ -1.46

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