RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 Q6ZR03 302 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 LINC00479Q96M42 142 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 PRNDQ9UKY0 176 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CACNA1AO00555 2505 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 GPX1P07203 203 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 GABRA6Q16445 453 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 MGST2Q99735 147 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.76□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 J3QR89 54 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CCL25O15444 150 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 GNG7O60262 68 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 ORM1P02763 201 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CD3EP07766 207 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 PPOXP50336 477 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 MLANAQ16655 118 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 PAXXQ9BUH6 204 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 IL36BQ9NZH7 164 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.75□□□□□ -1.49
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NEDD9-216ENST00000620854 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 NOTCH2Q04721 2471 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 DPRXA6NFQ7 191 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 MGST3O14880 152 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 YPEL1O60688 119 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CD99P14209 185 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CD24P25063 80 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 GCHFRP30047 84 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 KIR2DS2P43631 304 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 UQCRFS1P47985 274 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 GFRA1P56159 465 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 RELBQ01201 579 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 KLRB1Q12918 225 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CENPWQ5EE01 88 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 PRNTQ86SH4 94 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 YPEL2Q96QA6 119 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 PGPA6NDG6 321 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 F5H697 171 aa5.75□□□□□ -1.49
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NEDD9-216ENST00000620854 REG1AP05451 166 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 C3orf79P0CE67 100 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 FOXF2Q12947 444 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 FAM201AQ5SY85 155 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 GP6Q9HCN6 339 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 TCF19Q9Y242 345 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 COTL1Q14019 142 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 EFNB3Q15768 340 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 PMCHL1Q16048 86 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 Q1RN00 199 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 Q8N7P7 452 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 STPG3Q8N7X2 389 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.74□□□□□ -1.49
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NEDD9-216ENST00000620854 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.74□□□□□ -1.49
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NEDD9-216ENST00000620854 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 IGFBP2P18065 325 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 TCF15Q12870 199 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 UTF1Q5T230 341 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 SLC25A17O43808 307 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 NDUFB8O95169 186 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 STAG3L2P0CL84 134 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 STAG3L3P0CL85 134 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 NMUP48645 174 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 LINC00596Q86U02 117 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD9-216ENST00000620854 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.74□□□□□ -1.49
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