RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	UCP1	P25874	307 aa		10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	MEF2D	Q14814	521 aa		10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
FCHO1-231	ENST00000600201	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB3D	O95716	219 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	BSX	Q3C1V8	233 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	MZT2A	Q6P582	158 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RARRES2	Q99969	163 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	COPZ2	Q9P299	210 aa		10.83	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	C4BPB	P20851	252 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	SNCA	P37840	140 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	OPRK1	P41145	380 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	GPR146	Q96CH1	333 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	FBXL17	Q9UF56	701 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RABAC1	Q9UI14	185 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CLN5	O75503	358 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	NPBWR1	P48145	328 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TAS2R19	P59542	299 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	PRR20E	P86478	221 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	PRR20C	P86479	221 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	PRR20D	P86480	221 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	PRR20B	P86481	221 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	PRR20A	P86496	221 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201		K7EQG2	157 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	P2RY1	P47900	373 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	ALDH3B2	P48448	385 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201		Q8NAQ8	132 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	AP3S1	Q92572	193 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RGS5	O15539	181 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CDS2	O95674	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TBP	P20226	339 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CRYBB3	P26998	211 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RND2	P52198	227 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	AARD	Q4LEZ3	155 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	NPPC	P23582	126 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	DEFB1	P60022	68 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201		U3KQE9	123 aa		10.78	□□□□□ -0.68
FCHO1-231	ENST00000600201	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
FCHO1-231	ENST00000600201	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FCHO1-231	ENST00000600201	SPCS3	P61009	180 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FCHO1-231	ENST00000600201	PAFAH1B2	P68402	229 aa		10.77	□□□□□ -0.69
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM187	Q14656	261 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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