RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588551.5

POP4-208, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 3

Gene POP4, Length 789 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-208	ENST00000588551	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.47	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551		U3KQ87	197 aa		10.47	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551		A8MWP6	167 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	CORT	O00230	105 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	TMEM50A	O95807	157 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	CBLN1	P23435	193 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	ID3	Q02535	119 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
POP4-208	ENST00000588551	NDUFA4	O00483	81 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IFNA10	P01566	189 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IFNA21	P01568	189 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	NPY1R	P25929	384 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	OPRK1	P41145	380 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		10.45	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	C15orf62	A8K5M9	175 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	SYNGR2	O43760	224 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	GNG7	O60262	68 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IL5	P05113	134 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IAPP	P10997	89 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	GP9	P14770	177 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	NPBWR1	P48145	328 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.44	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551		K7EMT4	169 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	WRB	O00258	174 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	CLN5	O75503	358 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	MED6	O75586	246 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	LY86	O95711	162 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IGKV1-17	P01599	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	NOXA1	Q86UR1	476 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	PALMD	Q9NP74	551 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	MLX	Q9UH92	298 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.43	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	CCS	O14618	274 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	SLC25A4	P12235	298 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	CD69	Q07108	199 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551		Q8N1Y9	231 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	MARC2	Q969Z3	335 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	YIF1A	O95070	293 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IFNA4	P05014	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	RND2	P52198	227 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	PAX9	P55771	341 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.41	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	PRSS46	E5RG02	174 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	DEFA1	P59665	94 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	DEFA3	P59666	94 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	GAMT	Q14353	236 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.4	□□□□□ -0.74
POP4-208	ENST00000588551	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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