RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-218ENST00000584243 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 VWC2LB2RUY7 222 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 B9A039 149 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PRSS46E5RG02 174 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PPIAL4DF5H284 164 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 J3QR06 171 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 UPK2O00526 184 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 MT-ND6P03923 174 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 AKR1C3P42330 323 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 GALR1P47211 349 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 TMEM177Q53S58 311 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 ZFP82Q8N141 532 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 LYG1Q8N1E2 194 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 RFESDQ8TAC1 157 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 NEUROG1Q92886 237 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 C5orf30Q96GV9 206 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 GAFA1Q96PS6 74 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 RNF5Q99942 180 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.52□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PRE2 83 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BKO60814 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BJP06899 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 FABP1P07148 127 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR9G9P0C7N8 305 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BOP23527 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 S100A7P31151 101 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BBP33778 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BDP58876 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 DSCR9P59020 149 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 ERVFRD-1P60508 538 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BCP62807 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PAX2Q02962 417 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR9G1Q8NH87 305 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 FZR1Q9UM11 496 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.51□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 TMEM178BH3BS89 294 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PAGE4O60829 102 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 SCGB2A1O75556 95 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1D-33P01593 117 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1-33P01594 117 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 GYPAP02724 150 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR4A8P0C604 315 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 OR10J4P0C629 311 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PDLIM4P50479 330 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PRRX1P54821 245 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 CTAG1AP78358 180 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PRR20EP86478 221 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PRR20CP86479 221 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PRR20DP86480 221 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PRR20BP86481 221 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 PRR20AP86496 221 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 ADIPOQQ15848 244 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 WDR73Q6P4I2 378 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 LINC01551Q86U37 167 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 STPG3Q8N7X2 389 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-218ENST00000584243 ZNF114Q8NC26 417 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms