RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 EBAG9O00559 213 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 SIVA1O15304 175 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 GYG2O15488 501 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 ATP8B1O43520 1251 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 SNAPC5O75971 98 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 DTYMKP23919 212 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 CLDN12P56749 244 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 DEFB1P60022 68 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 OR5I1Q13606 314 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 MSMO1Q15800 293 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 TPRA1Q86W33 373 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 CADM3Q8N126 398 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 TMEM80Q96HE8 168 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 RAB22AQ9UL26 194 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-212ENST00000582376 A0A0J9YY99 117 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 MARCH11A6NNE9 402 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PRM2P04554 102 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 M6PRP20645 277 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 RANBP1P43487 201 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ZNF79Q15937 498 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 CNIH2Q6PI25 160 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ZNF114Q8NC26 417 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 GFI1Q99684 422 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PRNDQ9UKY0 176 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 U3KQE9 123 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 SCGB2A1O75556 95 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 C1QBP02746 253 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 TSPOP30536 169 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 RORCP51449 518 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 OR51H1Q8NH63 302 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 LINC00052Q96N35 136 aa6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.25□□□□□ -1.41
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GGA3-212ENST00000582376 FAM78BQ5VT40 261 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ABHD1Q96SE0 405 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 LRP2P98164 4655 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 DBX1A6NMT0 343 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 H3BNG1 76 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 MYL12BO14950 172 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 CLN5O75503 358 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 KRASP01116 189 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 G6PCP35575 357 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ID1P41134 155 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 B2MP61769 119 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 COQ8AQ8NI60 647 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 TSC22D3Q99576 134 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 NXPH4O95158 308 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 INSP01308 110 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 AZU1P20160 251 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 FCGR2CP31995 323 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 RASSF2P50749 326 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PAX9P55771 341 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 KIR3DS1Q14943 382 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ARL6IP1Q15041 203 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 TIGITQ495A1 244 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 MED4Q9NPJ6 270 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.23□□□□□ -1.41
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