RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 METTL26Q96S19 204 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PRD5 423 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PRF3 423 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PRM7 423 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 LIME1Q9H400 295 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 H3BVH4 76 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PSPNO60542 156 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 SRRM5B3KS81 715 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 SFTPCP11686 197 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01559Q495D7 138 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 NUDT11Q96G61 164 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 COX6CP09669 75 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 GFRA3O60609 400 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PPBPP02775 128 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 TSPOP30536 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 LYPD6Q86Y78 171 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 NKX2-8O15522 239 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PPP1R17O96001 155 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 HBDP02042 147 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 FAM106CPP0CH98 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 GAGE1Q13065 139 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 ECSCRQ19T08 205 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF524Q96C55 264 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PS18 150 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 NTF4P34130 210 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 ID1P41134 155 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 HSD52Q0P140 79 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-205ENST00000577827 H3BUT2 72 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 MMP23AO75900 390 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PYYP10082 97 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C16orf92Q96LL3 132 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 VCX2Q9H322 139 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF726P1Q15940 193 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 GNG5P63218 68 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 SNAI2O43623 268 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ESPL1Q14674 2120 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PINLYPA6NC86 204 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 ITGB1BP1O14713 200 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM160Q9NX00 188 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00473A8K010 186 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 J3KRW8 73 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C18orf15Q96N68 181 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 LILRA1O75019 489 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 FAM201AQ5SY85 155 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-205ENST00000577827 COX11Q9Y6N1 276 aa8.56□□□□□ -1.04
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