RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.04□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C9JCJ5 164 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 E7EQL1 145 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LYNX1G3V0Z9 82 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLAUP00749 431 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LYNX1P0DP58 116 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCL1AP56279 114 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPEL1Q2QD12 228 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TIGITQ495A1 244 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MMD2Q8IY49 270 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM186Q96B77 213 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PN81 502 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FCN1O00602 326 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX7A2P2O60397 106 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PYYP10082 97 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HCP5Q6MZN7 132 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDPNQ86YL7 162 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR1L6Q8NGR2 347 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SERTAD4Q9NUC0 356 aa10.03□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCGB1D1O95968 90 aa10.02□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.02□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.02□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TACC2O95359 2948 aa10.02□□□□□ -0.8
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CGB1A6NKQ9 187 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SHISA9B4DS77 424 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 G0S2P27469 103 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNLZQ5SXM8 178 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00479Q96M42 142 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NGBQ9NPG2 151 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SNURFLB1AK76 121 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GCGP01275 180 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JKAMPQ9P055 326 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 V9GYV3 84 aa10.02□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV2-23P01705 113 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM87AP0C7U9 286 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MISP3Q96FF7 219 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MOSP00540 346 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD33P20138 364 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LGALS4P56470 323 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TBR1Q16650 682 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 REC114Q7Z4M0 266 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHODLQ9H9P2 273 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PPI3 338 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRISP2P16562 243 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ORM2P19652 201 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CNTFRP26992 372 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM155Q4W5P6 130 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC01560Q8TB33 94 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MS4A10Q96PG2 267 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PRE2 83 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CA1P00915 261 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNXAQ16473 311 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAXXQ9BUH6 204 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DLX6P56179 175 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BAGE3Q86Y29 109 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BAGE2Q86Y30 109 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00311Q8N616 119 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms