RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NEURL3Q96EH8 262 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00479Q96M42 142 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 FRG2BQ96QU4 278 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 JPT2Q9H910 190 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 PELI2Q9HAT8 420 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 DOCK4Q8N1I0 1966 aa3.69□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CGB1A6NKQ9 187 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TEX22C9J3V5 150 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NPIPB6E9PJ23 425 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 RRHO14718 337 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 LDB3O75112 727 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 MPDU1O75352 247 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NKX2-2O95096 273 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CLDN7O95471 211 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 B3GALT4O96024 378 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 RBP4P02753 201 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TNFRSF4P43489 277 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CSN1S1P47710 185 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NMUP48645 174 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 EFNB2P52799 333 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM50BP56557 158 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 HBG1P69891 147 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 HBG2P69892 147 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 PLGLB1Q02325 96 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 FAM53BQ14153 422 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF141Q15928 474 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 C4orf26Q17RF5 130 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CR1LQ2VPA4 569 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 SPRNQ5BIV9 151 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CT83Q5H943 113 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 AMTNQ6UX39 209 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NPWQ8N729 165 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF114Q8NC26 417 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NUP35Q8NFH5 326 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF721Q8TF20 911 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 COPS9Q8WXC6 57 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00526Q96FQ7 95 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 C9orf85Q96MD7 179 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 RETNQ9HD89 108 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 HIGD1BQ9P298 99 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 RAXQ9Y2V3 346 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 MYO16Q9Y6X6 1858 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.68□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NUMA1Q14980 2115 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 HCFC1P51610 2035 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 A0A0A6YYD5 115 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 A0A0J9YW62 118 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 LINC01553A4QN01 128 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 C2orf70A6NJV1 201 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 A8MWL6 223 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 IGLL5B9A064 214 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 C11orf94C9JXX5 98 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 F2Z2F3 143 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 H0YIG0 161 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 M0R2P5 195 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 PAGE4O60829 102 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 PRB1P04280 392 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 NOVP48745 357 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 DYNLT3P51808 116 aa3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
C15orf40-210ENST00000563387 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms