RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 CADM3Q8N126 398 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N402 240 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 OR4A16Q8NH70 328 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 OR4C12Q96R67 309 aa3.25□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 BET1LQ9NYM9 111 aa3.25□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.25□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 FAM223BA6NKX1 122 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 H0Y980 276 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 H3BP45 60 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ST8SIA3O43173 380 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 IFNA17P01571 189 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 IAPPP10997 89 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GP9P14770 177 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ETV6P41212 452 aa3.24□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 NECAP1Q8NC96 275 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM230Q96A57 120 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM18Q96B42 140 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SEC22AQ96IW7 307 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.24□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 NAA60Q9H7X0 242 aa3.24□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.23□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 A0A0G2JLM5 398 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 H3BUA1 57 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CCSO14618 274 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 YIF1AO95070 293 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 DHFRP00374 187 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CD74P04233 296 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CD7P09564 240 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 CTRB1P17538 263 aa3.23□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 MAS1LP35410 378 aa3.23□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 PLET1Q6UQ28 207 aa3.23□□□□□ -1.89
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TMOD3-204ENST00000558666 TERB2Q8NHR7 220 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 BORCS5Q969J3 196 aa3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TMOD3-204ENST00000558666 PRRT1Q99946 306 aa3.23□□□□□ -1.89
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