RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555743.1

PSMA3-208, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-208	ENST00000555743	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743		U3KQK5	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TSPAN4	O14817	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	LY86	O95711	162 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	ANXA3	P12429	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	HTR2B	P41595	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	AKR1C2	P52895	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	MFAP4	P55083	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SP6	Q3SY56	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	MLX	Q9UH92	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	RYR3	Q15413	4870 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TNC	P24821	2201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A1B0GU03	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	PITX3	O75364	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	MT-CO2	P00403	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SNCA	P37840	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	NPBWR1	P48145	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CCR6	P51684	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743		U3KQ87	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CLN5	O75503	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM50A	O95807	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	IFNA17	P01571	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC25A4	P12235	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	EDN2	P20800	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CD81	P60033	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	HAGH	Q16775	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	LGI3	Q8N145	548 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA3-208	ENST00000555743	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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