RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551336.1

RPLP0-222, Transcript of ribosomal protein lateral stalk subunit P0, human

TSL 3

Gene RPLP0, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPLP0-222	ENST00000551336	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	SCGB2A1	O75556	95 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	B3GALNT1	O75752	331 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	IL7	P13232	177 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	PMS2P11	Q13670	270 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	SP6	Q3SY56	376 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	RNF183	Q96D59	192 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	OR10C1	Q96KK4	312 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	NAA60	Q9H7X0	242 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336		I3L2K1	104 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	OR5AC1	P0C628	307 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	UCP1	P25874	307 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	SNCA	P37840	140 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	NPBWR1	P48145	328 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	TMEM230	Q96A57	120 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	LYST	Q99698	3801 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	DBX1	A6NMT0	343 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	CORT	O00230	105 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	CHEK1	O14757	476 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	MT-CO2	P00403	227 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	14.67	□□□□□ -0.06	2e-11	■■■□□ 16.9
RPLP0-222	ENST00000551336	TRIM16L	Q309B1	348 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	SLC35G3	Q8N808	338 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	RNF2	Q99496	336 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	AKR1C2	P52895	323 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	S100Z	Q8WXG8	99 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	MPTX1	A8MV57	137 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	IGKV1-5	P01602	117 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	CCDC32	Q9BV29	185 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	CSTL1	Q9H114	145 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	ENY2	Q9NPA8	101 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPLP0-222	ENST00000551336	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	CDS2	O95674	445 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	LY6G6C	O95867	125 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	IFNA17	P01571	189 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336		P0C879	139 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	AKR1C4	P17516	323 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	CCR6	P51684	374 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	DHODH	Q02127	395 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	BTC	P35070	178 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TFPI2	P48307	235 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336		A0A1W2PS18	150 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	CENPX	A8MT69	81 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	ST8SIA3	O43173	380 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	DFFB	O76075	338 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TMEM187	Q14656	261 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TCF24	Q7RTU0	167 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	MFF	Q9GZY8	342 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	PRR13	Q9NZ81	148 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336		A0A0G2JRQ6	117 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	PLA2G10	O15496	165 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	NDUFB6	O95139	128 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336		A0A0B4J293	547 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RPLP0-222	ENST00000551336	FAM219A	Q8IW50	185 aa		14.6	□□□□□ -0.07

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