RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 GNG7O60262 68 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TMEM50AO95807 157 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 CD5P06127 495 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 CHEK1O14757 476 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TMEM187Q14656 261 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 SPINK9Q5DT21 86 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 OR4X1Q8NH49 305 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TMEM230Q96A57 120 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 GPR146Q96CH1 333 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 A0A0B4J2A0 478 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 OR4C46A6NHA9 309 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 IGHV3-48P01763 117 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 HTR2BP41595 481 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 C2orf83Q53S99 150 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 NMSQ5H8A3 153 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TRIM63Q969Q1 353 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 RNF2Q99496 336 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 GINS3Q9BRX5 216 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 VSIRQ9H7M9 311 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 ENY2Q9NPA8 101 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 V9GYH0 126 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 NUPR2A6NF83 97 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 CLN5O75503 358 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 YIF1AO95070 293 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 BMI1P35226 326 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 AP3S2P59780 193 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 Q6ZWC4 215 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 CCDC190Q86UF4 302 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 CACNG5Q9UF02 275 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-221ENST00000550734 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GU03 582 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 CCDC160A6NGH7 325 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 UBE2CO00762 179 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 IGKV1-17P01599 117 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 SLC25A4P12235 298 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 SRPXP78539 464 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 ZNF79Q15937 498 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 NOXA1Q86UR1 476 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 MCUBQ9NWR8 336 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 SCGB2A1O75556 95 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 ANXA3P12429 323 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 S100A5P33763 92 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 OPRK1P41145 380 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 CCR6P51684 374 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 APOC4P55056 127 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 TNFRSF9Q07011 255 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-221ENST00000550734 MLANAQ16655 118 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms