RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547283.5

CS-207, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-207ENST00000547283 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.61■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 CCR6P51684 374 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 LGI3Q8N145 548 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 DUSP18Q8NEJ0 188 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 SMPXQ9UHP9 88 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 CORTO00230 105 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 YIF1AO95070 293 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 TMEM50AO95807 157 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 OPRK1P41145 380 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 HTR2BP41595 481 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 NPBWR1P48145 328 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 TNFRSF9Q07011 255 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 ZMAT4Q9H898 229 aa15.59■□□□□ 0.09
CS-207ENST00000547283 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 A0A1B0GU03 582 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 CHEK1O14757 476 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 TSPAN4O14817 238 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 ANXA3P12429 323 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 SRPXP78539 464 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 PPP1R1AQ13522 171 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 SMCO1Q147U7 214 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 C2orf83Q53S99 150 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 OR4X1Q8NH49 305 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 CITED4Q96RK1 184 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RNF2Q99496 336 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RETNQ9HD89 108 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 HSPB7Q9UBY9 170 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RYR3Q15413 4870 aa15.57■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa15.57■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa15.57■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 VAMP1P23763 118 aa15.57■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 CLN5O75503 358 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 SFT2D2O95562 160 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 IGKV1-17P01599 117 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 APOHP02749 345 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 BTCP35070 178 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 TRIQKQ629K1 86 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 ZNF600Q6ZNG1 722 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 LRTM2Q8N967 370 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 TMEM116Q8NCL8 245 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 SPATA25Q9BR10 227 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RBKSQ9H477 322 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 STARD9Q9P2P6 4700 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 PITX3O75364 302 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 CENPSQ8N2Z9 138 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 LILRB2Q8N423 598 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 FLVCR2Q9UPI3 526 aa15.55■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 CSMD3Q7Z407 3707 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 NDUFB6O95139 128 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 NPY1RP25929 384 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 TIGITQ495A1 244 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 DTD1Q8TEA8 209 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 ST8SIA2Q92186 375 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.54■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 IGLC1P0CG04 106 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 IL7P13232 177 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RND2P52198 227 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 OR1S1Q8NH92 325 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 VSIRQ9H7M9 311 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 EDA2RQ9HAV5 297 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 CACFD1Q9UGQ2 172 aa15.53■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 INPP1P49441 399 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 GINS3Q9BRX5 216 aa15.52■□□□□ 0.08
CS-207ENST00000547283 SACSQ9NZJ4 4579 aa15.51■□□□□ 0.07
CS-207ENST00000547283 U3KQ87 197 aa15.51■□□□□ 0.07
CS-207ENST00000547283 C9orf170A2RU37 121 aa15.5■□□□□ 0.07
CS-207ENST00000547283 OR4C46A6NHA9 309 aa15.5■□□□□ 0.07
CS-207ENST00000547283 IFNA10P01566 189 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms