RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527136.1

SIGIRR-208, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene SIGIRR, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-208ENST00000527136 GNB4Q9HAV0 340 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MBD2Q9UBB5 411 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 DEDDO75618 318 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MPC2O95563 127 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OPRK1P41145 380 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RAP2BP61225 183 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RAB11AP62491 216 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 C15orf32Q32M92 178 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 C2orf83Q53S99 150 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 THAP6Q8TBB0 222 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 DCUN1D4Q92564 292 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SMIM8Q96KF7 97 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SPATA25Q9BR10 227 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RNF126Q9BV68 326 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 U3KQ87 197 aa8.44□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 IGSF23A1L1A6 192 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 H3BUA1 57 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CST7O76096 145 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 DEFB136Q30KP8 78 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 Q56UQ5 140 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ACSM6Q6P461 480 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF114Q8NC26 417 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 NECAP1Q8NC96 275 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ZFP57Q9NU63 452 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 THYN1Q9P016 225 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.43□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SMCO3A2RU48 225 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 FAM223BA6NKX1 122 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 E5RGE8 158 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 I3L2K1 104 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 K7EIM0 57 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TRBV12-3P01733 135 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 BSXQ3C1V8 233 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 AKAP14Q86UN6 197 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 NOXA1Q86UR1 476 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ACY3Q96HD9 319 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF747Q9BV97 191 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ATRQ13535 2644 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 A0A0G2JLM5 398 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OR2T8A6NH00 312 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PPP5D1E7EU14 171 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CORTO00230 105 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TSC22D2O75157 780 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PET100P0DJ07 73 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 GPR183P32249 361 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TAS2R30P59541 319 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CD300CQ08708 224 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 FGL1Q08830 312 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ARL16Q0P5N6 197 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 Q8N3U1 123 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RNF152Q8N8N0 203 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 USMG5Q96IX5 58 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CUBNO60494 3623 aa8.41□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CLEC3BP05452 202 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 P2RY1P47900 373 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RND2P52198 227 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MFAP4P55083 255 aa8.4□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms