RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 OR4A16Q8NH70 328 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 DNAH2Q9P225 4427 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PKHD1P08F94 4074 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRU-210ENST00000527027 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PRCDQ00LT1 54 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRU-210ENST00000527027 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 Q6ZTC4 211 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 SEC22AQ96IW7 307 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRU-210ENST00000527027 RABAC1Q9UI14 185 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 NAT1P18440 290 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TNFSF8P32971 234 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TAS2R46P59540 309 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 PHLDA2Q53GA4 152 aa11.67□□□□□ -0.54
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PTPRU-210ENST00000527027 S100ZQ8WXG8 99 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.67□□□□□ -0.54
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PTPRU-210ENST00000527027 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM50AO95807 157 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 SPP1P10451 314 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 NPPCP23582 126 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 S100GP29377 79 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 TAS2R20P59543 309 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTPRU-210ENST00000527027 X6R8D5 127 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1B0GU03 582 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PS18 150 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 K7EQG2 157 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 IGKV1-39P01597 117 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 IGKV1D-39P04432 117 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRU-210ENST00000527027 MED14OSP0DP75 135 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRU-210ENST00000527027 SNCAP37840 140 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC190Q86UF4 302 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRU-210ENST00000527027 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.62□□□□□ -0.55
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PTPRU-210ENST00000527027 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 AGRNO00468 2067 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 AMBPP02760 352 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 P0DMU3 169 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 FAM231AP0DMU4 169 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 FAM231CP0DMU5 169 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 UCP3P55916 312 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 C12orf74Q32Q52 190 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 SOSTQ9BQB4 213 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRU-210ENST00000527027 PKD1P98161 4303 aa11.61□□□□□ -0.55
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