RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524536.5

USP33-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, humanhuman

TSL 3

Gene USP33, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33-211ENST00000524536 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 GNGT1P63211 74 aa8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 RNF141Q8WVD5 230 aa8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 TMEM230Q96A57 120 aa8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.72□□□□□ -1.01
USP33-211ENST00000524536 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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USP33-211ENST00000524536 MARCH11A6NNE9 402 aa8.71□□□□□ -1.02
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USP33-211ENST00000524536 FXYD7P58549 80 aa8.71□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.71□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.71□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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USP33-211ENST00000524536 A6NHS1 94 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 CBY3A6NI87 242 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 IGKV3-20P01619 116 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ZNF114Q8NC26 417 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.7□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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USP33-211ENST00000524536 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.69□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.69□□□□□ -1.02
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USP33-211ENST00000524536 ZNF709Q8N972 641 aa8.69□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.69□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 TSC22D3Q99576 134 aa8.69□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 GFI1Q99684 422 aa8.69□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 NSG2Q9Y328 171 aa8.69□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 A0A087WTM6 91 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 M0QYG6 137 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ARL6IP5O75915 188 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 KRASP01116 189 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 PPP5CP53041 499 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 HAMPP81172 84 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 PSG9Q00887 426 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 UHRF2Q96PU4 802 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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USP33-211ENST00000524536 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 U3KQE9 123 aa8.68□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 V9GY05 133 aa8.68□□□□□ -1.02
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USP33-211ENST00000524536 B2MP61769 119 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ESRGQ1W209 222 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 OR51H1Q8NH63 302 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 GLMPQ8WWB7 406 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 BORCS5Q969J3 196 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.67□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 FCGR2CP31995 323 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ID1P41134 155 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 CDNFQ49AH0 187 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 HACD4Q5VWC8 232 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.66□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 CORTO00230 105 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 CLN5O75503 358 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 PPYP01298 95 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 P0C879 139 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 F2RP25116 425 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 TSPOP30536 169 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ABHD1Q96SE0 405 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
USP33-211ENST00000524536 ATP8B1O43520 1251 aa8.64□□□□□ -1.03
USP33-211ENST00000524536 M6PRP20645 277 aa8.64□□□□□ -1.03
USP33-211ENST00000524536 G6PCP35575 357 aa8.64□□□□□ -1.03
USP33-211ENST00000524536 SNCAP37840 140 aa8.64□□□□□ -1.03
USP33-211ENST00000524536 OR5I1Q13606 314 aa8.64□□□□□ -1.03
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