RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MT-CO2P00403 227 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 AMY1AP04745 511 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZS49 121 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 G6PCP35575 357 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V0BQ99437 205 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GV72 72 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 H3BUT2 72 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CD40P25942 277 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CRYBA4P53673 196 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CENPWQ5EE01 88 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FAM168AQ92567 244 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CADP27708 2225 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 H0Y8G0 127 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FOXH1O75593 365 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CGAP01215 116 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CHODLQ9H9P2 273 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-DQA1P01909 254 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DS4P43632 304 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 BSPH1Q075Z2 132 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 KIR2DS1Q14954 304 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 NRN1LQ496H8 165 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM42Q69YG0 159 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 WDR82Q6UXN9 313 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FZR1Q9UM11 496 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CD24P25063 80 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 CRYBB3P26998 211 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 PERPQ96FX8 193 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 STAG3L2P0CL84 134 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 STAG3L3P0CL85 134 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 CRYGSP22914 178 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 PLP1P60201 277 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 MIC13Q5XKP0 118 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 LRRK2Q5S007 2527 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 CECR9P0C854 216 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 GPR183P32249 361 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 RAB1CQ92928 201 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 COL8A1P27658 744 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 VWC2Q2TAL6 325 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF488Q96MN9 340 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 CREBBPQ92793 2442 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 K7EP34 96 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 GNG4P50150 75 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 RAB37Q96AX2 223 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 TIMD4Q96H15 378 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 SPRY3O43610 288 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 APOA2P02652 100 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC30A6NM36 301 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 C9JCJ5 164 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf1O96002 111 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 SIGMAR1Q99720 223 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 PCSK5Q92824 1860 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 GCHFRP30047 84 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 MC5RP33032 325 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00205P59089 165 aa8.25□□□□□ -1.09
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.25□□□□□ -1.09
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