RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 C8orf49Q96NF6 230 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 YPEL2Q96QA6 119 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.51□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.5□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.5□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.5□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 EPM2AB3EWF7 344 aa5.5□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 SNCGO76070 127 aa5.5□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 TCRAP04437 139 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 RNF11Q9Y3C5 154 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 INAFM1C9JVW0 142 aa5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 K7EQG2 157 aa5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 M0R378 163 aa5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 YPEL1O60688 119 aa5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 PITX3O75364 302 aa5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 CHD4Q14839 1912 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 SOD1P00441 154 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 ELK1P19419 428 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 TWIST1Q15672 202 aa5.48□□□□□ -1.53
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PDCD4-211ENST00000498367 SCXQ7RTU7 201 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 MYH4Q9Y623 1939 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ECM29Q5VYK3 1845 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ABCA3Q99758 1704 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 RGS12O14924 1447 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 DYSFO75923 2080 aa5.47□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.47□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.47□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.47□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0J9YW62 118 aa5.47□□□□□ -1.53
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