RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM213	A2RRL7	107 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	LGALS9	O00182	355 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CORT	O00230	105 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	WRB	O00258	174 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	PITX3	O75364	302 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	YIF1A	O95070	293 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CTSG	P08311	255 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	NPBWR1	P48145	328 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	BSX	Q3C1V8	233 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	TXN2	Q99757	166 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	FAM25E	A8MYX2	175 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CCS	O14618	274 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	MED6	O75586	246 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SCGB1D2	O95969	90 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IFNA4	P05014	189 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SLC25A6	P12236	298 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	GP9	P14770	177 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CBLN1	P23435	193 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	C2orf83	Q53S99	150 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	PALMD	Q9NP74	551 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024		H3BP45	60 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	NDUFA4	O00483	81 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SYNGR2	O43760	224 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM50A	O95807	157 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	RND2	P52198	227 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	DEFA1	P59665	94 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	DEFA3	P59666	94 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	NOXA1	Q86UR1	476 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	MLX	Q9UH92	298 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024		U3KQ87	197 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	C5orf51	A6NDU8	294 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	C15orf62	A8K5M9	175 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024		A8MWP6	167 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SSSCA1	O60232	199 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CLN5	O75503	358 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	RAB11A	P62491	216 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	TIGIT	Q495A1	244 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	LCN12	Q6JVE5	192 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	BTNL8	Q6UX41	500 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	OR4X1	Q8NH49	305 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	NPIPB3	Q92617	1050 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	IL5	P05113	134 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SLC25A4	P12235	298 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ID3	Q02535	119 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CALD1-223	ENST00000496024	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms