RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 NBASA2RRP1 2371 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KRASP01116 189 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00869P0C866 280 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ECI1P42126 302 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CD177Q8N6Q3 437 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf30Q96GV9 206 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNA1DQ01668 2161 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 A6NDN8 102 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM250H0YL14 139 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 F2RL2O00254 374 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MGST3O14880 152 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF737O75373 536 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDN1O95832 211 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDT3O95989 172 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DRB1P01911 266 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 AMTP48728 403 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC11AP67812 179 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC21Q5SSG8 566 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 BRICD5Q6PL45 260 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 LGI3Q8N145 548 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNS1Q96KK3 526 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5SQ99766 215 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF665Q9H7R5 613 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR13Q9NZ81 148 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF114Q9Y508 228 aa5.94□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 DSCAMO60469 2012 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf118A6NHY6 69 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 H0YJW9 148 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PSPNO60542 156 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf79P0CE67 100 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5J2P56134 94 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM78BQ5VT40 261 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF787Q6DD87 383 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GLMPQ8WWB7 406 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CYYR1Q96J86 154 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.93□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPR1 153 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 C7orf71A4D174 169 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM231BA6NCW3 169 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFP92A6NM28 416 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BRM9 83 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QKU1 62 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPB6O14558 160 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GYPAP02724 150 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA2G2AP14555 144 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 LCN15Q6UWW0 184 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZPA2 131 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 BORCS7Q96B45 105 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GAFA1Q96PS6 74 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 C3orf80F5H4A9 247 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ST8SIA3O43173 380 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KALRNO60229 2985 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 COX6B1P14854 86 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CR1LQ2VPA4 569 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4A5Q8NH83 315 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL17Q92583 94 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF183Q96D59 192 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 COQ2Q96H96 371 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB9BQ9NP90 201 aa5.92□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ICE1Q9Y2F5 2266 aa5.91□□□□□ -1.46
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