RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493658.2

ARID1B-208, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 3

Gene ARID1B, Length 974 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-208	ENST00000493658	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	PLAU	P00749	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	THAP8	Q8NA92	274 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	LINC01560	Q8TB33	94 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	CCL21	O00585	134 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	FOXH1	O75593	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	ACTL6B	O94805	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	C8orf88	P0DMB2	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	FOXL1	Q12952	345 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	PSG5	Q15238	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	MUC15	Q8N387	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	SLC25A17	O43808	307 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	FABP1	P07148	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	SOD3	P08294	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	SELENOT	P62341	195 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	PFDN5	Q99471	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ARID1B-208	ENST00000493658	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658		A0A1W2PRE2	83 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	OR7C2	O60412	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	COL8A2	P25067	703 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	BPIFB3	P59826	476 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	PRSS8	Q16651	343 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	OR1P1	Q8NH06	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	AKAP9	Q99996	3911 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658		A0A1W2PPI3	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	SIAH2	O43255	324 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	COX7A2P2	O60397	106 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	CRYGB	P07316	175 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	PAX2	Q02962	417 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	OCC1	Q8TAD7	63 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658		A0A0U1RQK1	487 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658		E7EUB6	86 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	MLANA	Q16655	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARID1B-208	ENST00000493658	RNF5	Q99942	180 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms