RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB24Q969Q5 203 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 MISP3Q96FF7 219 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ACY3Q96HD9 319 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 GNG13Q9P2W3 67 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TNCP24821 2201 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A096LNT2 108 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPV4 95 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SCO1O75880 301 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CRYGCP07315 174 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 APELAP0DMC3 54 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 BCL2P10415 239 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10J1P30954 320 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 MFAP2P55001 183 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR20EP86478 221 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR20CP86479 221 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR20DP86480 221 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR20BP86481 221 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR20AP86496 221 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PMS2P11Q13670 270 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ICAM4Q14773 271 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 MLANAQ16655 118 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 KHDC3LQ587J8 217 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 THAP8Q8NA92 274 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ARPC1AQ92747 370 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RARRES2Q99969 163 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.24□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFP92A6NM28 416 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00869P0C866 280 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RHOBP62745 196 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CX3CL1P78423 397 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 GUCA2BQ16661 112 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N9W7 124 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 NPIPB3Q92617 1050 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 Q96MF0 132 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 MANBALQ9NQG1 85 aa8.23□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 J3QLI3 93 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SNAPINO95295 136 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 MT-CO2P00403 227 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-DRB1P01911 266 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFA4P12838 97 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CTRB1P17538 263 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 RND2P52198 227 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SELENOTP62341 195 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 VAX2Q9UIW0 290 aa8.22□□□□□ -1.09
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0U1RQK1 487 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CXorf1O96002 111 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-48P01763 117 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 STAG3L2P0CL84 134 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 STAG3L3P0CL85 134 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMB3P49720 205 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NDPQ00604 133 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TRGV9Q99603 122 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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