RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MISP3Q96FF7 219 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 LY6G6DO95868 133 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 RND2P52198 227 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ECSCRQ19T08 205 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZRG5 221 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 OR5T1Q8NG75 326 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 OR4X1Q8NH49 305 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 NPIPB3Q92617 1050 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CXorf58Q96LI9 332 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TRGV9Q99603 122 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 RPRMQ9NS64 109 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 THYN1Q9P016 225 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.49□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 NUDT19A8MXV4 375 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 G3V318 75 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 H3BUA1 57 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 AP4M1O00189 453 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CLN5O75503 358 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 YIF1AO95070 293 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TSPAN15O95858 294 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PRH1P02810 166 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 LINC00869P0C866 280 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 M6PRP20645 277 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 OR10J1P30954 320 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 FHITP49789 147 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CFHR3Q02985 330 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MIC13Q5XKP0 118 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZS46 218 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ACY3Q96HD9 319 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 VSIRQ9H7M9 311 aa8.48□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 CLDN34H7C241 214 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 NDUFB8O95169 186 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 RAB2AP61019 212 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 B2MP61769 119 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SELENOTP62341 195 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 Q8N2B8 174 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 STPG3Q8N7X2 389 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 ATP6V0BQ99437 205 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TXN2Q99757 166 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.47□□□□□ -1.05
OPTN-211ENST00000486862 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 F8W735 103 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 OR2J3O76001 311 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-48P01763 117 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 IGLC1P0CG04 106 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 CD99P14209 185 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 NPBWR1P48145 328 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 MFAP4P55083 255 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 ZNF726P1Q15940 193 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 COMMD1Q8N668 190 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 NECAP1Q8NC96 275 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 SMR3AQ99954 134 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 ZNF702PQ9H963 129 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.46□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.45□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.45□□□□□ -1.06
OPTN-211ENST00000486862 TMEM89A2RUT3 159 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms