RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	CORT	O00230	105 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	FCN1	O00602	326 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SERF1A	O75920	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	F2R	P25116	425 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTDAP	P60985	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	STPG4	Q8N801	248 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	DYRK2	Q92630	601 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	COQ2	Q96H96	371 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A1W2PPV4	95 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR7C2	O60412	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	VAMP5	O95183	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	CXorf1	O96002	111 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	HAND1	O96004	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGHE	P01854	428 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TIMP3	P35625	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	LHX2	P50458	406 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	RUNX1	Q01196	453 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PAX2	Q02962	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	RP1	P56715	2156 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	HSBP1	O75506	76 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TSHB	P01222	138 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	CD55	P08174	381 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF17	P17021	662 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TFPI2	P48307	235 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	GPM6A	P51674	278 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PAX9	P55771	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PCBD1	P61457	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	RIG	Q13278	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	RAB31	Q13636	194 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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